Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmnb1P14733 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmnb1P14733 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms