Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20878L7N244 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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