Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3542K7N6U2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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