Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5225J3QPL3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5225J3QPL3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5225J3QPL3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm5225J3QPL3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm5225J3QPL3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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