Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim18J3QNP2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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