Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm340F6RGI3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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