Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r68E9Q0V3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms