Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf518bB2RRE4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf518bB2RRE4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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