Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Grik3B1AS29 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms