Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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