Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms