Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn6Q9Z262 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn6Q9Z262 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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