Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tnfrsf19Q9JLL3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf19Q9JLL3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms