Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MsraQ9D6Y7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MsraQ9D6Y7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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