Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q9D4W2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q9D4W2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms