Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Urm1Q9D2P4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Urm1Q9D2P4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Urm1Q9D2P4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Urm1Q9D2P4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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