Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms