Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc3Q9CXE6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms