Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Nicn1Q9CQM0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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