Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q8C708 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q8C708 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Q8C708 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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