Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms