Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Slc5a6Q5U4D8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Slc5a6Q5U4D8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms