Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rtl5Q5DTT4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms