Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Kdm4dQ3U2K5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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