Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
V1rd19Q3KNP5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms