Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tff2Q03404 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms