Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp39Q02525 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms