Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme3P61290 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms