Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp3P58854 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp3P58854 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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