Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp4P35123 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms