Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms