Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18530 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18530 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18530 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms