Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18525 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18525 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms