Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stag2O35638 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stag2O35638 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms