Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21818J3KMS6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21818J3KMS6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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