Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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