Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ush1cQ9ES64 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms