Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn2Q9ER65 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms