Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pop5Q9DB28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pop5Q9DB28 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Pop5Q9DB28 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pop5Q9DB28 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pop5Q9DB28 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pop5Q9DB28 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Pop5Q9DB28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pop5Q9DB28 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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