Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SlirpQ9D8T7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms