Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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