Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc47Q9D024 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms