Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MINDY3Q9CV28 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms