Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp3Q9CQ10 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp3Q9CQ10 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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