Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pacsin3Q99JB8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Pacsin3Q99JB8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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