Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smc1bQ920F6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc1bQ920F6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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