Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc12Q8K2L8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms