Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pnma1Q8C1C8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms