Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx13Q6PHS6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms