Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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